蛋白乳酸化修饰检测新方法:PLA临近链接技术给你答案

蛋白乳酸化修饰可谓是近今年蛋白翻译后修饰中的流量明星。 蛋白乳酸化修饰是一种近年来新发现的、依赖乳酸作为底物的蛋白质翻译后修饰方式。其过程是,乳酸先转化为乳酰辅酶A,再在特定酶的催化下,将乳酰基共价连接到蛋白质(包括组蛋白和非组蛋白)的赖氨酸残基上。

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蛋白乳酸化修饰检测新方法:PLA临近链接技术给你答案
蛋白乳酸化修饰可谓是近年蛋白翻译后修饰中的流量明星。

蛋白乳酸化修饰是一种近年来新发现的、依赖乳酸作为底物的蛋白质翻译后修饰方式。其过程是,乳酸先转化为乳酰辅酶A,再在特定酶的催化下,将乳酰基共价连接到蛋白质(包括组蛋白和非组蛋白)的赖氨酸残基上。这种修饰如同一个“功能开关”,能够改变蛋白质的结构和功能,进而调控基因表达、细胞代谢、免疫反应等多种关键生理过程。值得注意的是,这个过程是动态可逆的,由专门的“写入酶”(例如P300)和“擦除器”(例如HDACs)共同精密调控。作为一个连接细胞代谢与基因调控的重要纽带,乳酸化修饰的异常与肿瘤、炎症、心血管疾病及神经退行性疾病等多种病理状态密切相关。

图 1 组蛋白乳酸化位点
图 2 组蛋白与非组蛋白乳酸化过程
常规研究目标蛋白乳酸化修饰研究方法

依据已有文献报到过的修饰,购买位点特异性抗体进行WB的实验,例如H3K18la(货号:S0B6743),H3K9la(货号:S0B0756)可是若我研究的蛋白全网没有Reference,岂不是我就要抓瞎?

当然我也可以用IP技术把目标蛋白富集下来,先利用乳酸化泛抗体(货号:S0B6731 & S0B0719)进行WB检测,然后我再进行定点突变(货号:210519),进一步确认修饰位点。

当然我们还有修饰组学的法宝,利用乳酸化修饰泛抗体的beads (货号:S0F0036)富集样本中的所有修饰肽段再进行质谱分析,实现一网打尽。

那么有没有一种方法可以快速定位我感兴趣的目标是否存在乳酸化修饰呢?
有的,我们是有的!
今天我们来分享一种全新的目标蛋白乳酸化修饰检测方法:PLA临近链接技术在原位层面上让乳酸化修饰无所遁形!
原理

PLA通过一对标记寡核酸(单链DNA)的抗体探针,识别目的蛋白,当两个探针之间的距离靠近,产生了所谓的邻近效应(proximity)。加入一段与寡核酸互补的DNA序列,互补配对后进行扩增,从而显色,检测目标蛋白,蛋白相互作用等,这个突破了基于荧光的原位方法的界限,使研究人员能够在分子水平上原位可视化和量化蛋白质、它们的相互作用和修饰,从而从每次分析中获得最大信息。整个技术兼容ELISA的特异性和qPCR的灵敏度,通过荧光显微镜或共聚焦显微镜实现高效灵敏PTM信号检测。

图 3 PLA实验原理和流程

PLA 技术在磷酸化修饰的检测中已有了一些应用。但是由于修饰泛抗尤其是前沿修饰泛抗研发难度较大,优质的修饰一抗反而成为了PLA在PTM应用上的障碍。但是斯达特依托专有重组兔单B细胞抗体重组技术开发了20+修饰泛抗。这些抗体均经过严格验证,可以满足WB IHC等多种应用,同时也提供修饰抗体定制服务。高性能的抗体从源头上解决了一抗对于PLA技术的阻碍,使PLA技术检测前沿修饰不再只是想象。

实验材料
  • Navinci PLA 试剂盒(货号:60025
  • 斯达特乳酸化泛抗体(货号:S0B0719, 重组兔单抗)
  • 组蛋白H3 一抗(鼠单抗)
  • 细胞系:HeLa cells + Lactate sodium处理
实验流程
  1. 细胞固定:4% PFA处理
  2. 一抗孵育
  3. PLA 专利二抗孵育: Navenibody M1 和 Navenibody R2 1:40稀释,在37℃中孵育60min
  4. 扩增反应:
    • 添加 PLA Enzyme 1 1:40稀释在37℃中反应30min
    • 添加 PLA Enzyme 2 1:40稀释在37℃中反应90min (避光)
  5. 染DAPI和封片
  6. 使用荧光显微镜拍照
结果展示
A、阳性样本
图 4 PLA在组蛋白H3乳酸化检测. 使用乳酸化泛抗体S0B0719(稀释比1:500)

B、阴性对照

 

 

 PLA 技术可以实现快速定位和检测目的蛋白是否产生乳酸化修饰,并且可以通过图像分析软件实现乳酸化修饰的定量分析,且该技术不依赖专有设备,实验室常见的荧光显微镜或共聚焦显微镜就可以实现拍片。
斯达特提供优质抗体搭配优宁维独家代理的Navinci PLA试剂盒助您乳酸化修饰研究!

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斯达特生物 · 修饰抗体专家

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本文由斯达特技术专家团审核发布

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