2023年8月18日，世卫组织将携带大量基因突变的新冠病毒奥密克戎亚谱系BA.2.86标为“目前流行中需监视的变异株”，奥密克戎的传播对全球都构成严峻挑战。自从新冠病毒在全球范围内爆发以来，我们一直在与病毒进行一场无休止的赛跑，更好地理解病毒的传播方式和致病机制，从而找到更有效的预防和治疗策略。

新冠病毒感染的关键在于病毒表面刺突蛋白的受体结合结构域（receptor-binding domain，RBD）与人体细胞表面膜蛋白ACE2的特异性结合。刺突蛋白（Spike glycoprotein, S蛋白）是I型跨膜蛋白，含有一个发挥受体结合域功能的亚基S1（即RBD）和介导病毒膜囊与细胞融合的亚基S2。ACE2在肺部、胃肠道、肾脏等人体多器官中均有表达，感染导致多器官受损。

图1 SARS-CoV-2与ACE2结合图示

BA.2.86

BA.2.86被称为“第二代奥密克戎BA.2变异株新谱系”，2023年7月下旬在丹麦和以色列首次被发现。在全球范围内，BA.2.86报告比例正在缓慢且稳定地增加，在流行病学第44周，其全球患病率约为8.9%，与四周前（2023.10.2-8）的报告数据相比大幅上升。

BA.2.86含有大量与当前流行菌株明显差异的突变：与BA.2相比，它有33个刺突蛋白突变和12个受体结合域突变；与XBB1.5相比，有35个刺突蛋白突变和12个RBD突变^[1]。与BA.2晶体结构相比，BA.2.86中的新突变位点主要位于S蛋白S1亚基的N端结构域（NTD）和RBD区域^[2]。奥密克戎的不断进化导致许多变异株同时出现，尽管进化过程不同，但RBD上的突变会聚集在几个热门位点，比如会增强免疫逃逸的BA.2.86 RBD上的483del^[1]。

图2 BA.2.86相比于BA.2的突变残基

也有研究显示BA.2.86没有显示出显著的免疫逃逸能力和生长优势，但它却有非常高的ACE2结合亲和力。此种亲和力与其独特的抗原性，可以使BA.2.86在低流行水平中积累免疫逃逸突变^[3]。有研究人员使用测试假病毒感染靶细胞（Vero细胞和人ACE2-HEK293T）来评估BA.2.86感染细胞能力，结果表明BA.2.86的传染性低于XBB.1.5，但其对ACE2的亲和力（KD值）分别是EG.5的3倍和XBB.1.5的2.4倍。

JN.1

JN.1是BA.2.86的新型变体，于2023年底首次出现，继承了BA.2.86的抗原多样性和额外的L455S突变，JN.1可通过降低与ACE2的结合来实现更高的免疫逃避能力，已迅速成为主要变异毒株，世卫组织也将JN.1单独列为需留意的新冠变异株。

JN.1是迄今为止免疫逃逸能力最强的变异株之一。JN.1的传染性高于BA.2.86，且L455S突变并不影响其抗原性，JN.1对单价XBB.1.5疫苗血清表现出强大的抗性^[4]。有研究通过XBB感染恢复健康的个体血浆进行基于SARS-CoV-2假病毒的中和检测，研究JN.1的体液免疫逃避，与BA.2.86相比，JN.1的免疫逃逸能力显著增强，且在血浆中也表现出更强的中和逃避，血浆中和滴度也显著低于亲本菌株，有更强的生长优势^[5]。

图3 SPR检测其受体结合域亲和力

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